Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms