Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NME5P56597 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NME5P56597 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME5P56597 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME5P56597 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms