Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms