Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms