Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms