Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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