Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms