Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms