Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms