Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms