Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms