Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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