Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XBP1P17861 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms