Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms