Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DESP17661 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DESP17661 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DESP17661 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms