Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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