Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms