Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RLBP1P12271 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms