Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APODP05090 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms