Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F9P00740 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F9P00740 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F9P00740 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F9P00740 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F9P00740 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F9P00740 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F9P00740 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F9P00740 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms