Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POP4O95707 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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