Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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