Protein–RNA interactions for Protein: O75610

LEFTY1, Left-right determination factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEFTY1O75610 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEFTY1O75610 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms