Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms