Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms