Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QRK9 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QRK9 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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