Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E9PBE3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms