Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms