Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms