Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms