Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms