Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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