Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL20Q9Y2M5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL20Q9Y2M5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms