Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms