Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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COPS3Q9UNS2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS3Q9UNS2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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