Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TRAPPC2LQ9UL33 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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