Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RIMS3Q9UJD0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RIMS3Q9UJD0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RIMS3Q9UJD0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RIMS3Q9UJD0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RIMS3Q9UJD0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIMS3Q9UJD0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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