Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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