Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms