Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00474Q9P2X8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms