Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REREQ9P2R6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REREQ9P2R6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms