Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP2BPQ9P2M1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP2BPQ9P2M1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms