Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CCDC88CQ9P219 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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