Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CNIH4Q9P003 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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