Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms