Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL1Q9NSC2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms