Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms