Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms