Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms