Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms